超凈空氣的流量為24～30m/min，這已足夠防止附近空氣可能襲擾而引起的污染，如此的流量也不會妨礙采用酒精燈或本生燈對器械等的灼燒消毒。工作人員就在如此的無菌條件下運行，保持無菌材質在轉移接種經過中不受污染。但是萬一運行中途遇到停電，暴露在未過濾空氣中的材質便難以幸免污染。這時應迅速結束工作，并在瓶上作出記號，內中的材質如處于增殖階段，則以后不再用作增殖而轉入生根培養。如為一般性生產材質，因極其豐富也可棄去。如處于生根經過，則可留待以后種植用。
凈化工作臺的使用管理：
1.目的：維持屏障系統的生物潔凈度，保護工作人員的安全，維護動物福利，保障機組的正常運轉，盡量減少可影響科研成果的各種可變因素。
2. 潔凈臺使用管理：
(1.) 濾材每半年更換一次，并作好更換記錄。
(2.) 每次使用時，實驗人員應先開啟紫外燈，紫外照射20分鐘后使用。
(3.) 整個實驗過程中，實驗人員應按照無菌操作規程操作。
(4.) 實驗結束后，用消毒液擦拭工作臺面，關閉工作電源，重新開啟紫外燈照射15分鐘。
(5.) 如遇機組發生故障，應立即通知動物實驗室，由專業人員檢修合格后繼續使用。
(6.)開啟工作電源，關閉紫外燈，并用75%的酒精或0.5%過氧乙酸噴灑擦拭消毒工作臺面。