FFU的使用方式是,新風有新風空調機處理至所需狀態點后送入,在靜壓箱內與回風混合后經風機加壓后經HEPA或ULPA送入室內,再經架空地板或側墻回至干盤管,在此經冷(熱)處理后經由回壓機送回至靜壓箱完成循環。這樣的系統最為常用于有超靜要求的潔凈室，如大型集成電路晶圓的制造、尖端顯示器如TFT、PDP等的制造、硬盤的制造等。
系統風管很少，除新風以風管送達外，大量的回風以小循環的方式在運行，因此大大減少了風管的阻力消耗。同時由于FFU的面風速一般為0.35~0.45m/s,過濾器阻力小,無殼風機功率很小,新型的FFU采用了高效率電動機,同時對風機葉輪形狀也進行了改進,其綜合效率以大為提高。據筆者估算，一般可比集中送風的凈化系統節能30%以上，使系統在二、三年內就可通過節省電費把增加的初投資部分(與集中送風的凈化系統相比)省回來。